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Max-Planck-Institut für Dynamik komplexer technischer Systeme

CellNetAnalyzer

MATLAB Toolbox mit graphischer Benutzeroberfläche zur biologischen Netzwerkanalyse.

CNApy

Eine Python-basierte Version des CellNetAnalyzer zur Analyse metabolischer Netzwerke. mehr

LiNA

MATLAB-Tool zur Analyse von intrinsischem Rauschen in biochemischen Reaktionsnetzwerken.

Fachgruppenleiter

Assistenz

Susann Kasch

+49 391 6110-477 sek-arb@...

Neuigkeiten / Letzte Publikationen

14.09.2021 Neue Publikation
Schneider P, Radhakrishnan M, Klamt S (2021) Systematizing the different notions of growth-coupled product synthesis and a single framework for computing corresponding strain designs. Biotechnology Journal e2100236 Link

25.06.2021 Neues Softwarepaket CNApy erschienen
Die erste Version unserer neuen Software CNApy zur Modellierung und Analyse von metabolischen Netzwerken ist erschienen.

https://github.com/cnapy-org/CNApy/tree/gh-pages

25.06.2021 Neue Publikation
Harriehausen I, Bollmann J, Carneiro T, Bettenbrock K, Seidel-Morgenstern A (2021) Characterization of an Immobilized Amino Acid Racemase for Potential Application in Enantioselective Chromatographic Resolution Processes. Catalysts 2021 11: 726 Link

15.06.2021: Neue Publikation
Bekiaris PS, Klamt S (2021) Designing microbial communities to maximize the thermodynamic driving force for the production of chemicals. PLoS Computational Biology 17: e1009093 Link

09.03.2021: Neue Publikation
Boecker S, Harder B-J , Kutscha R, Pflügl S, Klamt S (2021) Increasing ATP turnover boosts productivity of 2,3-butanediol synthesis in Escherichia coli. Microbial Cell Factories 20: 63 Link

11.02.2021: de.NBI Workshop
Die ARB-Gruppe ist Mitorganisator des de.NBI Kurses "Tools for systems biology modeling and data management" vom 20.-22.4.2021 (online). Registrierung siehe Link.

01.01.2021: Neue Publikation
Novak K, Neuendorf CS, Kofler I, Kieberger N, Klamt S , Pflügl S (2021) Blending industrial blast furnace gas with H₂ enables Acetobacterium woodii to efficiently co-utilize CO, CO₂ and H_2. Bioresource Technology 323 : 124573 Link

09.11.2020: Neue Publikation
Zahoor A, Messerschmidt K, Boecker S, Klamt S (2020) ATPase-based implementation of enforced ATP wasting in Saccharomyces cerevisiae for improved ethanol production. BMC Bioinformatics 13: 185

09.11.2020: Neue Publikation
Klamt S , Mahadevan R, von Kamp A (2020) Speeding up the core algorithm for the dual calculation of minimal cut sets in large metabolic networks. BMC Bioinformatics 21: 510.

25.08.2020: Neue Publikation
Rexer T, ..., Boecker S, Bettenbrock K , ..., Reichl U (2020) Synthesis of lipid-linked oligosaccharides by a compartmentalized multi-enzyme cascade for the in vitro N-glycosylation of peptides. Journal of Biotechnology 322(10): 54-65

31.07.2020: de.NBI Modeling Workshop
Die ARB-Gruppe ist Mitorganisator des de.NBI Kurses "Tools for systems biology modeling and data management" vom 21.-23.9. 2020 (in Magdeburg oder online). Für Registrierung siehe Link.

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