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Max-Planck-Institut für Dynamik komplexer technischer Systeme

CellNetAnalyzer

MATLAB Toolbox mit graphischer Benutzeroberfläche zur biologischen Netzwerkanalyse.

CNApy

Eine Python-basierte Version des CellNetAnalyzer zur Analyse metabolischer Netzwerke. mehr

LiNA

MATLAB-Tool zur Analyse von intrinsischem Rauschen in biochemischen Reaktionsnetzwerken.

Fachgruppenleiter

Susann Kasch

+49 391 6110-477 sek-arb@...

Neuigkeiten / Letzte Publikationen

06.10.2023 Neue Publikation
Boecker S, Schulze P, Klamt S (2023) Growth-coupled anaerobic production of isobutanol from glucose in minimal medium with Escherichia coli. Biotechnology for Biofuels and Bioproducts 16:148. Open Access

04.08.2023 Neue Publikation
Bekiaris P S, Klamt S (2023) Network-wide thermodynamic constraints shape NAD(P)H cofactor specificity of biochemical reactions Nature Communications 14:4660 Open Access

18.04.2023 Neue Publikation
Wichmann J, Behrendt G, Boecker S, Klamt S (2023) Characterizing and utilizing oxygen-dependent promoters for efficient dynamic metabolic engineering. Metabolic Engineering, 77:199-207. Open Access

12.12.2022 Neue Publikation
Li Z, Nees M, Bettenbrock K, Rinas U (2022) Is energy excess the initial trigger
of carbon overflow metabolism? Transcriptional network response of carbon-limited
Escherichia coli to transient carbon excess. Microbial Cell Factories 21:67 Open Access

28.11.2022 Neue Publikation
Schneider P, Bekiaris PS, von Kamp A, Klamt S (2022) StrainDesign: a comprehensive
Python package for computational design of metabolic networks. Bioinformatics 38:4981-4983.
Open Access

28.11.2022 Neue Publikation
Behrendt G, Frohwitter J, Vlachonikolou M, Klamt S, Bettenbrock K (2022) Zymo-Parts: A Golden Gate Cloning Toolbox for Heterologous Gene Expression in Zymomonas mobilis. ACS Synthtic Biology 11:3855-3864. Open Access

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